Microsc. Microanal. Microstruct. 7, 477-484 (1996)
DOI: 10.1051/mmm:1996147

Global and Non Parametric Classification Methods Using Mathematical Morphology: Application to DNA Ploidy Measurement of Archival Solid Tumors

Christophe Boudry^{1, 2, 3}, Michel Coster¹, Paulette Herlin², Brigitte Sola³ et Jean-Louis Chermant<sup>1

1</sup>  Laboratoire d'Études et de Recherches sur les Matériaux, URA CNRS 1317, ISMRA, 14050 Caen Cedex, France
²  Service d'Anatomie Pathologique, Centre F. Baclesse, 14021 Caen Cedex, France
³  CYCERON, Université de Caen, URA CNRS 1829, 14074 Caen Cedex, France

Abstract
Most of sorting methods applied to images in biology uses parametric measurements (object per object) followed by data analysis. Mathematical morphology offers tools able to treat images globally. Up to now, this opportunity has been under employed. The goal of the present paper is to propose global sorting methods, applied to the automatic elimination of aggregates and small debris, for DNA ploidy quantification. Results obtained illustrate the powerfulness and efficiency of global mathematical morphology treatments as sorting method.

Résumé
La majorité des tris d'objets biologiques effectués en analyse d'images fait appel à la mesure de paramètres (objet par objet) suivie d'une analyse des données. La morphologie mathématique offre des outils susceptibles de traiter les images globalement. Jusqu'à présent, cette opportunité a été sous employée pour les tris d'objets. Le but du présent article est de proposer des méthodes globales de tri, appliquées à l'élimination des agrégats et des petits débris, pour la mesure de l'ADN ploïdie des tumeurs solides. Les résultats illustrent la puissance et l'efficacité des traitements globaux par morphologie mathématique utilisés comme méthode de tri.

PACS
8780 - Biophysical instrumentation and techniques.
0760P - Optical microscopy.
8725F - Physics of subcellular structures.
7510B - Radiation and radioactivity applications in biomedicine.
6140C - Optical information, image and video signal processing.
7330 - Biology and medical computing.
5260B - Computer vision and image processing techniques.

Key words
biological techniques -- biology computing -- cellular biophysics -- DNA -- image classification -- mathematical morphology -- optical microscopy -- DNA ploidy measurement -- archival solid tumors -- sorting methods -- parametric measurements -- global sorting methods -- aggregates -- small debris -- automatic elimination -- data analysis


© EDP Sciences 1996